一、清水灌溉，科学用水。绿色食品水稻一定要用天然清水灌溉，绝对不能用工业废水、生活污水灌溉。
二、合理施肥，早生快发。水稻施肥的原则是“少吃多餐”，前控中补后控，农肥、化肥、生物肥结合，氮、磷、钾结合，A级绿色食品允许使用化肥，但必须限量施用，AA级绿色食品不能用化肥，只能用农机肥和生物肥。稻田施用鸡粪效果好，但用量要适当，时间要抢前，施入要均匀，并发酵好，一般每亩施入量大体1000公斤左右，鲜粪可少些，陈粪可多些。
水稻本田追肥要分期进行，大体分为分蘖肥、调节肥、穗肥和粒肥等。绿色食品水稻要追有机肥、细肥和生物菌肥，促进生育，提早成熟，增加产量，改善品质。
三、消灭杂草，促进生育。稻田杂草种类很多，因此要严格选择，必须选择有“三证的，高效低毒低残留的除草剂，AA级绿色食品水稻不能用化学除草剂除草，要用人工除草，一般进行推二遍，菇三遍，后期割净池埂草和渠道杂草，利用通风透光，提高光合利用率。九月初拿净稗穗。
四、防病灭虫，虫口夺粮。防病虫主要进行生物和物理及人工等办法，防治病虫害。水稻潜叶蝇可采取浅水灌溉，或除掉寄生的池埂草。稻瘟病要搞好田间调查，一旦发生，可用生物农药进行防治，比如用青雷霉素防治，还可用炉内灰加白石灰防治，方法是按4：1比例混拌均匀，分早晚各一次在发病地块扬施，每隔5天一次，共扬2～3次即可。